Los proyectos de investigación son uno de los principales ejes del Instituto CAPAZ. En ellos se prueban nuevos conceptos para entender y explicar la existencia de los conflictos y la construcción de paz en Colombia. Desde 2017, el Instituto CAPAZ ha apoyado proyectos de este tipo dando importancia a la construcción de redes de conocimiento entre academia, gobierno y sociedad civil. De igual forma, los proyectos de investigación fomentan la cooperación binacional entre instituciones de Colombia y Alemania.
Linea1: Prácticas para construir la paz
Esta área investiga las dinámicas que toman las acciones prácticas implementadas por distintos actores tanto institucionales como de la sociedad civil, con el objetivo de contribuir a la construcción de paz, especialmente desde las regiones de Colombia. Especial atención se dará a temas de educación para la paz y memoria histórica.
Linea 2: Justicia transicional y derechos humanos
El área se concentra en investigar sobre el diseño, la implementación y el seguimiento de los mecanismos jurídicos e institucionales necesarios para la terminación definitiva del conflicto armado colombiano y que logre la máxima satisfacción posible de los derechos de las víctimas.
Linea 3: Paz, conflictos y reconfiguraciones territoriales
Esta área de investigación analiza las relaciones de poder y las luchas alrededor del territorio, las cuales traen como consecuencia distintos tipos de conflictos que inciden en la generación de violencia y producen desigualdades socio-económicas. En esta área se busca explicar la reconfiguración de los intereses de los distintos actores implicados en la construcción de una paz estable y duradera en Colombia, incorporando el territorio como un eje fundamental de articulación de los conflictos.
Linea 4: Paz Ambiental
Esta línea investiga las consecuencias socio-ambientales del conflicto armado colombiano y las dinámicas socio-ambientales después de la firma de los acuerdos de paz en 2016. Los temas incluyen, entre otros, deforestación, biodiversidad, extractivismo, conflictos socio-ambientales, transición energética, salud ambiental y agroecología. A partir del análisis de la relación entre conflicto armado, paz y protección medioambiental, esta línea temática pretende aportar al entendimiento de la importancia de frenar el cambio climático.